Методы метатеоретического уровня - диалектический и системного анализа. Центральная задача на данном уровне - познание условий формализации научных теорий и выработка формализованных языков, именуемых метаязыками.
А.Т. Глазунов (2002) выделяет две особенности научного познания. Первая и самая главная особенность - это ориентация науки на изучение объектов, которые могут быть включены в деятельность (либо актуально, либо потенциально как возможные объекты ее будущего преобразования), и их исследование как подчиняющихся объективным законам функционирования и развития.
Нацеленность науки на изучение не только объектов, преобразуемых в сегодняшней практике, но и тех объектов, которые могут стать предметом массового практического освоения в будущем, является второй отличительной чертой научного познания. Эта черта позволяет понять, почему теоретическое исследование выступает определяющей характеристикой развития науки.